Messerer wurde 1954 in Wolframs-Eschenbach geboren. Er studierte Theologie und Philosophie in Eichstätt und Jerusalem. 1980 trat er in den Franziskanerorden ein. Anschließend studierte er Pastoralpsychologie im Institut für soziale Kommunikation in Innsbruck. In Eichstätt empfing Messerer am 29. Juni 1985 die Priesterweihe. Danach wirkte er als Kaplan in Bamberg-Sankt-Heinrich und Dettelbach. 1988 ging er zudem nach Frankfurt am Main und absolvierte dort eine zweijährige Ausbildung zum Meditations- und Exerzitienleiter. In Dietfurt leitete er danach Zenkurse und war zugleich Direktor des Meditationshauses Sankt Franziskus. 2007 wurde er Pfarradministrator der Pfarreiengemeinschaft „Maria im Sand, Dettelbach“. 2012 wurde Messerer Pfarradministrator in der Pfarreiengemeinschaft „Sankt Jakobus der Ältere im Oberen Werntal, Poppenhausen“ sowie Präses des Katholischen Deutschen Frauenbunds (KDFB) Poppenhausen/Hain, ab 2013 auch Präses der Katholischen Arbeitnehmer-Bewegung (KAB) im Ortsverband Poppenhausen. 2014 wurde er in das Bistum Würzburg inkardiniert. Seither ist er Leiter der Pfarreiengemeinschaft „Sankt Jakobus der Ältere im Oberen Werntal, Poppenhausen“. Im April 2025 wurde er zudem zum Leiter der Pfarreiengemeinschaft „Marienbachtal, Hambach“ im Pastoralen Raum Schweinfurt Nord-West ernannt.
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